Společnost FCC Česká republika, s.r.o. poprvé získala po úspěšné certifikaci společností DNV certifikáty systému řízení jakosti a enviromentálního managementu dle norem ISO 9001 a ISO 14001 dne 15.6. 2000 a stala se tak první společností v oblasti nakládání s odpady, která tento certifikát získala jako integrovaný. Od roku 2001 je integrovaný systém řízení platný a závazný i ve skupině firem FCC v ČR.
V roce 2003 byl tento systém řízení dále rozšířen o oblast OHSAS 18001 (řízení BOZP) a jako celek je tento integrovaný systém řízení zaveden a je certifikován (červen 2003) ve všech společnostech skupiny FCC ČR. V listopadu 2019 splnila společnost FCC podmínky přechodu v oblasti BOZP na normu ISO 45001 a v dubnu 2020 prošla úspěšně certifikací.
V roce 2019 prošly společnosti FCC úspěšně certifikací na normu management hospodaření s energií ISO 50001.